MATERIALS INTELLIGENCE · CHAPTER 03

XRD
全流程分析管理生态

从一条衍射曲线开始,完成物相初判、交叉验证、结构精修与可追溯的数据归档。把一次测量,变成下一次研究可复用的知识。

分享与教学 · 作者:曹斌 and ChatGPT · 2026

01 · THE BIG PICTURE

一条 XRD 数据,不该止步于“看过了”

实验结束后,仪器通常只交给我们一个 .xy.xrdml.csv 文件。真正困难的部分刚刚开始:它对应什么相?结果可信吗?结构是否发生细微变化?几个月后,我们还能找到原始数据、判断依据和可下载的结构文件吗?

01 / INPUT原始谱图xy · xrdml · csv
02 / QUERY快速初筛给出结构候选
03 / VERIFY交叉验证峰位与强度比对
04 / REFINE结构精修理解真实偏离
05 / ARCHIVE归档与共享数据可追溯、可引用
02 · BACKGROUND KNOWLEDGE

开始之前:XRD 究竟在告诉我们什么?

X 射线衍射(X-ray Diffraction, XRD)记录的是晶体中不同原子面散射 X 射线后产生的干涉图样。峰的位置主要与晶面间距有关,峰的相对强度则还会受到原子种类、占位、择优取向和实验条件影响。

nλ = 2d sin θ  Bragg 定律:λ 为 X 射线波长,d 为晶面间距,θ 为衍射角。

因此,数据库中的理论衍射峰与实验曲线对得上,是“该结构可能存在”的有力证据,但不是终点。峰位整体偏移可能来自晶格变化或仪器零点;峰展宽常与晶粒尺寸、微应变有关;额外峰则可能提示杂相。每一步都要把这些可能性留在判断里。

03 · STEP 1 / FAST SCREENING

用 XQueryer:从原始数据到结构候选

当你希望快速知道谱图“像什么”,可以将原始 XRD 文件上传至 XQueryer 的 Query 模块。它覆盖 XRD 模拟、物相识别、简单精修与多相分解;这里先使用最直接的物相查询流程。

XQueryer 功能首页截图
图 1. XQueryer 的功能导览:模拟、查询、精修与多相分解位于同一入口。
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注册并进入 Query

从 Query 进入相识别页面。该功能需要先在右上角注册或登录。

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上传单个谱图

点击 Select Single File 导入数据。若已知样品包含哪些元素,选择元素范围能缩小候选空间,通常会提高识别的针对性。

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检查结果,而非只看第一名

上传过程会进行格式转换、基础检查与备份,再进入模型识别。结果页面会给出候选结构及其详细地址;建议把它视为下一步验证的起点。

XQueryer Query 上传页面截图
图 2. Query 页面可选择元素并导入单个 XRD 文件。

完成上传后,先确认扫描范围、峰形和背景是否与原始测量一致。只有输入数据本身可信,后续的候选排序才有意义。

XQueryer 数据导入后的识别界面截图
图 3. 数据导入后的识别界面:关注峰形、背景与异常区段。

识别完成后,XQueryer 会将候选结构及相关结果直接可视化展示。可从结果页进入结构详情,查看晶体信息并获取 CIF,作为后续峰位验证与精修的输入。

XQueryer 物相识别结果截图
XQueryer 识别结果. 候选结构的可视化输出;建议结合样品成分、主要峰与未解释峰进行判断。
04 · STEP 2 / CROSS-CHECK

用 XMatcher:把“候选”变成可检查的结论

当 XQueryer 给出候选后,我通常会再用 XMatcher 做识别与验证。它支持中文、英文、日文和韩文,且将单相识别、多相识别、PDF 全峰对比分开呈现,适合初学者逐项确认。

2.1 打开软件,选择正确的任务

下载并打开软件后,先从左侧的“数据导入”开始。页面中的三个模块分别对应不同问题:样品预计只有一种主要晶相时先选单相自动识别;若已知存在杂相或混合物,再使用 AutoMix 自动多相识别;拿到候选 CIF 后,用 PDF 全峰对比检查整条谱图。

XMatcher 主界面截图
图 4. XMatcher 主界面及三个分析模块。

2.2 导入实验 XRD 数据

点击左侧“上传 XRD”。软件支持 CSV、TXT、XY、DAT、简单 JSON,以及常见 XRDML/XML;也可以直接粘贴两列 x, y 数据。默认会把前两列读作 2theta 和强度,因此导入前最好确认列顺序和单位。

XMatcher 上传 XRD 数据界面截图
图 5. 上传实验 XRD 数据,或直接粘贴两列数据。

完成导入后,展开相应模块即可开始分析。对于本例,我们首先使用单相自动识别获得候选结构,再将候选 CIF 带入 PDF 全峰对比;多相样品则应转入 AutoMix 模块。

XMatcher 三个分析模块截图
图 6. 单相自动识别、AutoMix 自动多相识别和 PDF 全峰对比模块。

2.3 先设置寻峰:决定“哪些实验峰值得用于判断”

寻峰不是把曲线上所有微小起伏都当作衍射峰。最低峰高、显著性、最小峰距和背景窗口共同决定哪些峰被保留;其中“峰数量”表示参与初步匹配的最强实验峰数量。一般而言,清晰峰越多,判断依据越充分;但当样品本身峰少、峰宽或信噪比较低时,阈值设得过高反而会得不到候选。

XMatcher 寻峰参数截图
图 7. 寻峰参数:可设置峰数量、最小峰高、显著性、最小峰距等。

2.4 再设置匹配:决定“多少证据才算通过”

“最少匹配峰”是很实用的过滤条件:候选结构的匹配峰数少于该值会被排除。峰位容差和最大平移用于处理仪器零点或样品整体峰位偏移;一般先使用适中的默认值,再依据标准样品与仪器条件调整。要求越严,结果通常更可靠,但也更可能漏掉峰弱或重叠的真实相。

XMatcher 匹配参数截图
图 8. 匹配参数:峰位容差、最少匹配峰、平移范围以及峰位/强度权重。

2.5 自动识别并查看候选列表

导入并设置完成后,点击自动识别。结果页会同时显示实验谱线、检测峰和经平移校正后的理论峰;下方列表给出候选化学式、匹配峰数、误差和空间群等信息。不要只看第一名:如果前几名分数接近,应结合样品的元素组成和制备条件继续排除。

XMatcher 自动识别图谱截图
图 9. 自动识别后的实验曲线、检测峰与理论峰位置。
XMatcher 候选结果表截图
图 10. 候选结果与匹配峰对列表;可点击 MP ID 进入结构详情并下载 CIF。

2.6 用 PDF 全峰对比做最后确认

在 PDF 模块中选择同一条实验 XRD 和候选 CIF,点击计算。这里不只看几个强峰:应检查主要峰位是否对齐、相对强度是否大致合理,以及是否仍有未被候选结构解释的强峰。图中实验谱与理论峰整体吻合时,才有理由把该结构作为可信的主相解释。

XMatcher PDF 全峰对比结果截图
图 11. PDF 全峰对比:实验图谱与候选 CIF 的理论衍射峰进行整体比较。
05 · STEP 3 / GO DEEPER

从“匹配到相”到“理解样品”:结构精修

真实样品不会是数据库结构的完美复刻。缺陷、残余应力、位错、晶格常数变化、原子占位变化,以及择优取向等,都可能改变衍射图样。物相识别回答“它可能是什么”;精修则试图进一步回答“它与理想结构差在哪里”。

精修前的准备

  • 保留原始谱图和仪器条件:辐射源、扫描范围、步长、狭缝及样品制备信息;
  • 选取经 PDF 对比验证过的 CIF,而不是只用排名最高的候选;
  • 先处理背景、零点与峰形,再逐步引入晶格、尺寸/应变、占位等参数;
  • 警惕“拟合很好但没有物理意义”:参数必须有合理的边界和解释。
06 · STEP 4 / KEEP IT FINDABLE

用 Xchange:让结果、依据和原始数据一起被保存

完成结构识别后,最容易被忽略的一步是数据管理:谱图、CIF、样品信息和论文链接往往散落在不同文件夹。Xchange 提供中英文 XRD 数据归档入口,让这一套证据可以被查找、管理和引用。

4.1 先浏览数据库,理解什么是一条完整记录

首页可以浏览平台中的公开数据。一条记录不只包含一张图,而是将实验 XRD、晶体结构、物相信息和审核状态组织在一起。

Xchange 数据库首页截图
图 12. Xchange 数据库首页;这里是实验 XRD 数据的浏览与归档入口。

4.2 注册并登录自己的账户

新用户点击注册,填写账号名、邮箱、工作单位和密码。注册信息的作用是声明数据贡献者;登录后,提交的数据会自动进入个人中心。未登录时也可浏览平台数据,但无法将记录绑定到自己的账户,也不支持下载完整数据。

Xchange 注册页面截图
图 13. 注册账号并填写贡献者基本信息。
Xchange 登录页面截图
图 14. 使用账号、邮箱与密码登录。

4.3 在个人中心管理历史数据与 VIP 权限

登录后会出现个人中心,集中显示你名下数据的审核状态和历史记录。VIP 下载权限会随贡献自动开启:当同一账号上传、并通过审核的数据累计达到 10 条及以上 时,系统会自动授予 VIP 权限。即使暂不下载数据库,个人中心本身也能避免“做完分析后找不到是哪次实验”的问题。

Xchange 个人中心截图
图 15. 个人中心:查看自己提交的数据、审核状态与下载权限。

4.4 贡献数据:XRD、CIF 与元数据缺一不可

点击“贡献数据”后,按顺序上传实验 XRD 和刚刚识别得到的 CIF;单相模式上传一个 CIF,多相模式可以上传多个 CIF。随后填写样品名称、化学式、物相名称、X 射线靶材/波长、测试日期、贡献者和实验备注等信息。这些元数据决定了别人能否理解和复现实验条件,不要只填一个化学式就提交。

Xchange 数据上传与元数据填写页面截图
图 16. 上传 XRD、CIF,并填写样品、测试条件和作者信息;确认三个模块完成后再提交。

4.5 审核后,形成可分享、可追溯的实验条目

数据入库后,记录页会同时显示 XRD 曲线、CIF、结构可视化、质检状态和推荐引用信息。若数据对应已发表论文,还可以补充文章链接或 DOI,使原始测量、结构解释与研究成果彼此关联。

Xchange 数据详情页面截图
图 17. 归档后的 XRD 数据记录:含曲线、结构、质检与推荐引用信息。
07 · TAKEAWAY

一份可直接照着做的 XRD 清单

MEASURE

测量后立刻保存

保留原始文件、仪器条件和样品编号;不要只保存处理后的图片或导出的峰表。

IDENTIFY

先初筛,再验证

用 XQueryer 得到候选,用 XMatcher 检查实验峰与理论峰的对应关系,并记录设置的参数。

EXPLAIN & ARCHIVE

把结论变成证据链

需要时开展精修;将 XRD、CIF、元数据和关联论文一起归档,方便自己和他人复用。